用TaqMan探针实时荧光PCR法快速鉴定瓜实蝇

地区:上海市 宝山区

关键词:凭祥出入境检验检疫局综合技术服务中心

成果类型:其它

成果领域:生物与新医药

成果编号:A2021061000005477

成果描述:

任务来源及背景:广西检验检疫局科技计划项目,项目名称,用TaqMan探针实时荧光PCR法快速鉴定瓜实蝇,项目编号2011K013。长期以来,实蝇的鉴定主要是基于其形态学的特征而确定的,由于生活环境不同,实蝇族昆虫形态特征,如斑纹、颜色等随之发生相应的变化,给鉴定带来困难甚至错误。在瓜果蔬菜的检疫中,常常获得的是实蝇的幼虫和卵,而实蝇幼虫很难用常规方法鉴定到种,而将幼虫和卵饲养到成虫再进行种类鉴定,需要较长的时间,影响到口岸检疫的运行速度和检疫质量,迫切需求建立一套快速、准确、切实可行的实蝇检测技术。技术原理及性能指标:通过检测特异性荧光探针结合到特异性扩增产物后水解发出的荧光,以检测DNA特异性扩增量。根据达到荧光阈值的循环数,即可判断检测目标的阴阳性。设计出了瓜实蝇探针法实时荧光PCR检测的特异性引物Bacqf:5’-CAGCTATTCCATACTTAGG-3’,Bacqr:5’-GGTGAAGAATCGAGTAAG-3’,以及特异性探针ProBac:5’-FAM-CGTTGTCAACAGCGAATCCTCC-TAMRA-3’。该研究建立了瓜实蝇快速鉴定的方法:受检虫体提取基因组DNA,三步法扩增,通过Ct值判断检测结果,Ct值<30为阳性,Ct值>30为阴性。该方法能够高效的将任何虫态的瓜实蝇(或其残体)与其近似种进行区分,大大地缩短了检测时间。技术的创造性及先进性:通过该研究,首次利用分子生物学的方法,通过TaqMan探针法实时荧光PCR对将瓜实蝇与其近似种进行了区分,实现了对瓜实蝇的分子鉴定。该研究通过综合试验所有样本测定的序列和Genbank中已发布的序列,根据cytb mtDNA区域中的保守序列,设计特异性引物和探针,经检测其特异性和检测灵敏度均能达到实用要求。技术的成熟程度,适用范围和安全性:该研究只设计了针对瓜实蝇的鉴定引物及探针,因此,对其他实蝇的鉴定还需要进一步完善试验数据,并使用更多样本检测该研究所采用引物的特异性和检测效果。该技术具有安全、快速、高效、准确的特点。应用情况及存在问题:该研究属于应用研究的初步研究阶段,尚未推广应用。但该研究所采用的方法具有简单易行、快速高效的特点,可以肯定具有良好的推广应用前景。虽然该研究使用了不同种和不同时间的同种的样本进行试验,而且综合了Genbank数据库里已经发表的序列信息,但由于果实蝇属种间、种内遗传关系的复杂性,该研究还需要进一步完善试验数据,使用更多样本检测该研究所采用引物的特异性和检测效果。同时,虽然该研究所采用的方法简单易行、快速高效,但由于不是所有的口岸实验室都具备进行实时荧光PCR实验的条件,同时探针法实时荧光PCR的费用也相对较高,因此推广应用上也有一定局限性。
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