地区：上海市 宝山区
关键词：北京大学;清华大学;北京大学第三医院;天津医科大学
成果类型：其它
成果领域：生物与新医药
成果编号：A2021061000002553
成果描述：
| 基因组学正处于从个体基因组学向细胞基因组学的重大变革中。融合单细胞操纵和基因组技术使项目组能够全面认识给定生理或病理组织的生物状态，在最高分辨率上观察基因型和表型的关系，并能从中获得仅在特定细胞表达的靶点、标志物或信号分子。这些靶点、标志物和相应的单细胞检测手段具有重要的临床应用前景。近年来，国际上报道的单细胞组学技术在通量、覆盖度、准确率、灵敏度和平行性方面均有进一步提升的空间，项目组将研发新一代单细胞组学技术和相关的生物信息技术，解决以往单细胞技术无法回答的临床和科学问题。肿瘤组织内癌细胞和微环境细胞成分复杂、其组织方式、相互作用、克隆差异仍很不清楚；染色体以及基因的异常会引起出生缺陷，反复性流产胚胎停育，虽然已有相对成熟的染色体异常的检测手段，但针对染色体微缺失和平衡易位的产前检测手段还远不能满足临床需求，亟需建立精确、简便、快速、有效的产前尤其是植入前胚胎遗传检测方法。因此，项目组选择肿瘤和生殖为突破口开展研究。一方面，项目组将发展和完善单个细胞基因组、转录组、表观遗传组的精准、无偏、均匀的扩增技术和快速、平行的测序技术，以及单细胞蛋白质检测技术，并提供相应的生物信息学工具和数据库。较现有方法提高检测的灵敏度、特异性，扩展变异类型，提高通量、降低成本、提升自动化水平。另一方面，通过搭建技术与临床紧密合作的团队，项目组将深入推进单细胞组学技术在肿瘤和临床研究中的应用。在肿瘤研究方面，开发血液检测技术，并对肿瘤干细胞和肿瘤组织微环境中的免疫细胞进行研究。在生殖研究方面，开发染色体平衡异位胚胎与正常核型染色体胚胎的鉴别诊断平台，并对囊胚外滋养层单细胞组学分析与胚胎后期发育潜能的关系开展研究，达到全面了解胚胎发育机制，找到影响胚胎着床因素，更准确地进行胚胎遗传学诊断。项目阶段性成果：（1）单细胞基因组测序技术。（2）单细胞转录组测序技术。（3）循环肿瘤细胞的单细胞测序研究。（4）单细胞组学在生殖医学中的应用。（5）肝癌的免疫单细胞研究。 |
