地区：上海市 宝山区
关键词：中国农业科学院柑桔研究所
成果类型：其它
成果领域：生物与新医药
成果编号：A2021061000005348
成果描述：
| 开发了Screen_miRNA软件，用于植物miRNA分子的发掘和鉴定。该软件将miRNA对应的前体序列从EST，GSS，Contig等序列中筛选出来，并根据miRNA前体二级折叠图形是否为茎环发夹结构,短读序列是否位于发夹结构的茎臂上，茎臂上短读序列与互补序列是否存在错配，以及折叠构像的最小自由能等结果综合判定短读序列是否是真正的miRNA分子，计算得到的茎环折叠发夹结构以JPG的格式保存在指定目录下。该软件对于判断短读序列是否是真正的miRNA分子具有重要价值，可为从事分子生物学、农学、生物学的科技工作者使用。Sreen_miRNA软件可快速、高效、高通量对植物的短读序列进行miRNA分子的发掘和判定。 |
