三种病原微生物必需基因的生物信息学分析

地区:上海市 宝山区

关键词:河北农业大学

成果类型:其它

成果领域:生物与新医药

成果编号:A2021061000003576

成果描述:

该课题首次发现了CpG二核苷酸在人、猪及禽类H1N1流感病毒(H1N1 Influenza Virus)的聚合酶片段中均被强烈抑制,且CpG抑制作用是制约同义密码子使用频率的一个重要因素;该项目明确了大肠杆菌的必要基因比非必要基因在进化上更为保守,首次发现两者在编码的蛋白质长度分布及氨基酸使用频率存方面存在显著的差异。必要基因在短的蛋白质序列区域(<139个氨基酸)和长的蛋白质序列区域(>534个氨基酸)的分布比率比非必要基因的高,而除组氨酸(H)外,所有的带电荷氨基酸均偏向于必要基因。通过全基因组分析,首次鉴定出在玉米大斑病菌中存在8个Homeobox转录因子基因家族成员,且均具有HOX保守结构域和Helix-Turn-Helix空间结构。该项目所研究的基因均可作为防治该三种病原微生物的候选药物靶标。该项目不仅为病原微生物致病基因功能的研究奠定了基础,也为探究其致病机制提供了新的思路。
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