林木数量性状基因解析理论与方法

地区:上海市 宝山区

关键词:北京林业大学

成果类型:其它

成果领域:生物与新医药

成果编号:A2021061000002136

成果描述:

研究目的: 森林是地球生态系统的主体,对维护生态环境、提升地区经济效益具有不可替代的作用。在森林资源严重匮乏的中国,选育速生、丰产与抗逆的林木品种,提高国土森林覆盖率,是一项长期的战略性任务。林木育种需要对性状遗传调控机理有深入的研究,但是,传统林木数量性状位点(QTL)大多套用动植物方法,缺少针对林木本身生物学特性的有效定位策略。该项目建立了一套适合林木的数量遗传学理论体系,对提升林木育种效率产生重要作用。 主要科学发现点: a)创立功能作图与系统作图理论:林木是多年生植物,研究林木生长与产量的关系是林木遗传学最重要的内容之一。候选人在国际上首次提出功能作图理论,把性状形成的生物学原理引入QTL定位,通过该项目把功能作图上升到系统作图高度,用一系列微分方程,数量化地分析与解释性状形成过程中各组成成分之间的网络关系。系统作图被认为是复杂性状基因定位最具突破性的方法之一。 b)推导出高维基因-基因及基因-环境高维互作分析模型:林木性状是多基因控制的,基因之间存在复杂的互作关系。当前使用的关联分析大多是基于单个基因或基因对的边际模型,未能考虑不同基因之间的互相关。借助变量选择的LASSO技术,候选人建立了能对所有QTL同时进行分析的联合模型,为系统构建复杂性状遗传结构图谱和发现所谓的“缺失遗传力”提供了重要分析工具。 c)发明生物形态性状QTL定位方法:林木在树型、分枝结构等性状存在显著变异,传统的长宽比等指标无法描述形态变异的解剖结构,候选人引入几何形态(geometric morphometrics, GM)技术,与QTL定位相组合,发展出量化各种形态变异的统计模型,有效鉴定形态性状调控QTL,分析QTL对不同形态变异类型、空间分布的影响。 d)提出林木高解析度QTL定位策略:针对林木异交特性,提出基于自由授粉子代的基因定位新方法。该方法首次把连锁分析与连锁不平衡分析整合在同一框架之中,不仅能精确定位QTL位置,还能推测QTL的进化历史。另外,这一联合分析能克服连锁不平衡分析可能产生的假阳性,显著提高QTL定位功效。 成果产生的价值: 该项目提出的几个理论与方法,打破动植物定位方法在林木基因定位应用中的局限性,从根本上开创林木基因解析新思路,将有力推进林木数量遗传学发展,同时也丰富了现代遗传学研究的内涵。代表性论文被Science等重要期刊引用。顶尖生物数学期刊Physics of Life Reviews专门发表五篇评论文章,介绍与宣传系统作图的理论与应用。
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